Prediction of conservative epitopes in the NS1 sequences of all four dengue virus serotypes
Tác giả: Hoang Xuan Cuong, Vu Minh Thuong, Do Nhu Binh, Dao Duc Tien, Bui Thuy Linh, Vo Thi Bich Thuy
Số trang:
P. 443-454
Số phát hành:
Vol 21 - Number 3
Kiểu tài liệu:
Tạp chí trong nước
Nơi lưu trữ:
03 Quang Trung
Mã phân loại:
610
Ngôn ngữ:
Tiếng Anh
Từ khóa:
Dengue virus, NS1, serotypes, epitope, homology modeling
Chủ đề:
Dengue virus
Tóm tắt:
The Dengue virus, transmitted by Aedes aegypti mosquitoes, causes dengue fever, a life-threatening illness. NS1 (Nonstructural Protein 1) has been widely used as a biomarker for detecting dengue due to its early occurrence, high sensitivity, and specificity. The main objective of this study was to design an epitope-rich peptide capable of identifying all four dengue serotypes using homology modeling. Homology protein modeling, a computational approach, predicts the 3D structure of a protein by comparing its sequence to a known template. To achieve this goal, various bioinformatics tools, such as Blast/NCBI, BepiPred, Discotope 2.0, and HADDOCK, were utilized.
Tạp chí liên quan
- Tăng cường sự tham gia của khu vực tư nhân thông qua hợp tác công - tư trong xử lý chất thải rắn sinh hoạt
- Các cơ chế tài chính thúc đẩy bảo tồn đa dạng sinh học và dịch vụ hệ sinh thái
- Đánh giá vai trò của nhận thức cộng đồng trong duy trì bền vững đô thị và phát triển dịch vụ hệ sinh thái tại công viên Tao Đàn
- Phát hành trái phiếu xanh tại Việt Nam : thực trạng và khuyến nghị
- Đề xuất các giải pháp ứng phó với đảo nhiệt đô thị để bảo vệ sức khỏe người dân và thích ứng với biến đổi khí hậu